Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TtrP07309 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TtrP07309 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TtrP07309 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TtrP07309 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TtrP07309 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms