Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Sfmbt2-203ENSMUST00000114862 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Rtel1-204ENSMUST00000108814 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Esd-201ENSMUST00000022573 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Clec10a-202ENSMUST00000102571 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Mkln1os-201ENSMUST00000139185 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Prpf31-206ENSMUST00000179769 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Dnajc5b-204ENSMUST00000165693 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms