Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms