Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RxrbP28704 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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