Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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PtpraP18052 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtpraP18052 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
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