Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms