Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms