Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms