Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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