Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 AC123069.1-201ENSMUST00000215094 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 E030024N20Rik-201ENSMUST00000075293 494 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Tmem69-202ENSMUST00000106478 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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