Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rb1cc1Q9ESK9 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms