Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms