Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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