Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
P04214 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
P04214 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
P04214 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms