Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

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Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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PtprbB2RU80 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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