Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpa3Q9CQ71 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms