Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ccdc18Q640L5 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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