Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm15433-201ENSMUST00000097671 891 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Defa29-201ENSMUST00000098890 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Dtna-201ENSMUST00000047954 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Zmym5-201ENSMUST00000039812 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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