Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rpa3Q9CQ71 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpa3Q9CQ71 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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