Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 CT025645.1-201ENSMUST00000222760 4322 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Arfgef2-201ENSMUST00000099078 8770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 D5Ertd579e-201ENSMUST00000031091 6677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.6 ms