Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Taf12-201ENSMUST00000030731 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Cpsf3-201ENSMUST00000067284 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm11239-201ENSMUST00000171348 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm11237-201ENSMUST00000178319 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm11236-201ENSMUST00000180092 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Orai2-202ENSMUST00000196454 3990 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm428-201ENSMUST00000084475 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd6-205ENSMUST00000108166 2321 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Sulf2-207ENSMUST00000146497 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Opn1sw-201ENSMUST00000080428 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Spata31d1b-201ENSMUST00000165133 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 AC159649.1-201ENSMUST00000220851 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Gm11238-201ENSMUST00000084479 1323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Lrrcc1-201ENSMUST00000091325 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Klf10-201ENSMUST00000074043 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Sbk3-202ENSMUST00000144863 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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