Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Il1r2-201ENSMUST00000027243 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 C2cd5-207ENSMUST00000203673 3332 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Rc3h2-203ENSMUST00000112936 5828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 Gm8346-201ENSMUST00000178968 1769 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm38130-201ENSMUST00000194311 1761 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Ddx1-201ENSMUST00000071103 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 C330007P06Rik-201ENSMUST00000047486 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43795-201ENSMUST00000202051 2366 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42868-201ENSMUST00000199168 2697 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 Gm14673-201ENSMUST00000121973 746 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Fhad1os1-201ENSMUST00000146094 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11707-201ENSMUST00000150366 490 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 Gm21784-201ENSMUST00000186639 694 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm31363-201ENSMUST00000199362 541 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 4933404K13Rik-203ENSMUST00000217125 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm36539-201ENSMUST00000217543 497 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm8278-201ENSMUST00000222840 1121 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Tectb-201ENSMUST00000025936 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ankrd33bQ3U0L2 Pcdh15-210ENSMUST00000125517 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr323-203ENSMUST00000214132 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Sp1-202ENSMUST00000163709 3134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Zscan5b-201ENSMUST00000072662 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Polr3k-201ENSMUST00000039551 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Thbs3-201ENSMUST00000029682 3190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 2810407A14Rik-202ENSMUST00000189929 2172 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Pdik1l-202ENSMUST00000105876 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Trim9-203ENSMUST00000167755 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Fam227b-201ENSMUST00000110446 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 BC025920-203ENSMUST00000119753 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Fancb-203ENSMUST00000167446 2953 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ankrd33bQ3U0L2 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms