Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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PtprmP28828 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprmP28828 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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