Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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