Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rrn3B2RS91 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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