Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms