Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms