Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms