Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Dkc1-201ENSMUST00000033776 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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