Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Rgs12-206ENSMUST00000114284 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Amph-204ENSMUST00000200466 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Otog-202ENSMUST00000209802 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhb6-201ENSMUST00000061717 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef10l-204ENSMUST00000105797 3507 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Cldn12-203ENSMUST00000115446 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Rpa1-201ENSMUST00000000767 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm5862-201ENSMUST00000072286 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh1-201ENSMUST00000057185 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ccnc-202ENSMUST00000102997 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Bcl6b-201ENSMUST00000000326 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr214-204ENSMUST00000215846 2605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Dpy19l4-201ENSMUST00000084892 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC115744.1-201ENSMUST00000222398 2379 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mavs-201ENSMUST00000041362 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Recql-203ENSMUST00000111803 3389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn3-203ENSMUST00000110133 2699 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Pcx-202ENSMUST00000113825 4044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm16023-201ENSMUST00000137752 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 D630023F18Rik-202ENSMUST00000148020 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr93-201ENSMUST00000171679 1045 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 C230072F16Rik-201ENSMUST00000219184 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 A930037H05Rik-203ENSMUST00000207446 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm44257-201ENSMUST00000204469 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Syt11-202ENSMUST00000107503 3575 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Tom1l1-203ENSMUST00000107868 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm28557-203ENSMUST00000186303 3886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Wdr12-203ENSMUST00000122038 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Tigar-201ENSMUST00000039913 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Abcb1b-201ENSMUST00000009058 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gpr85-202ENSMUST00000115491 2165 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Smok3b-201ENSMUST00000100537 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm10619-202ENSMUST00000186073 3287 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Esr2-203ENSMUST00000110421 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm38365-201ENSMUST00000195720 2993 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm24665-201ENSMUST00000104160 129 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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