Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms