Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CitP49025 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CitP49025 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CitP49025 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CitP49025 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CitP49025 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CitP49025 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CitP49025 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CitP49025 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CitP49025 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CitP49025 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CitP49025 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CitP49025 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms