Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrit3W8DXL4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrit3W8DXL4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms