Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria4Q9Z2W8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria4Q9Z2W8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms