Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I8

Suclg2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suclg2Q9Z2I8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Suclg2Q9Z2I8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Suclg2Q9Z2I8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Suclg2Q9Z2I8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Suclg2Q9Z2I8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Suclg2Q9Z2I8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Suclg2Q9Z2I8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Suclg2Q9Z2I8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms