Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd2Q9Z2E1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd2Q9Z2E1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms