Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms