Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stk39Q9Z1W9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stk39Q9Z1W9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stk39Q9Z1W9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stk39Q9Z1W9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Stk39Q9Z1W9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms