Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VarsQ9Z1Q9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VarsQ9Z1Q9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms