Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn15Q9Z0S5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn15Q9Z0S5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn15Q9Z0S5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn15Q9Z0S5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn15Q9Z0S5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn15Q9Z0S5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Cldn15Q9Z0S5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn15Q9Z0S5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn15Q9Z0S5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Cldn15Q9Z0S5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cldn15Q9Z0S5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cldn15Q9Z0S5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cldn15Q9Z0S5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn15Q9Z0S5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn15Q9Z0S5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn15Q9Z0S5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn15Q9Z0S5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn15Q9Z0S5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cldn15Q9Z0S5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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