Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Slit3Q9WVB4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slit3Q9WVB4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slit3Q9WVB4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms