Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam50aQ9WV03 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50aQ9WV03 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms