Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms