Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhx6Q9R1R0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms