Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms