Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb3Q9R1P1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms