Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr54Q9R0D8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms