Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf346Q9R0B7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms