Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Npas3Q9QZQ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Npas3Q9QZQ0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms