Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms